Zoon van Pieter Johan Boddaert en tekenaar Sara Agatha le Jolle. Hij trouwde Middelburg 1843 met Anna Petronella van Heeckeren van Brandsenburg en Middelburg 1861 met Elisabeth Carolina van Heeckeren van Brandsenburg. In 1844 legde hij het directeurschap neer om in 1858 wederom lid te worden.